Отделение лабораторной диагностики имеет следующие отделы:
- Общеклинический
- Гематологический
- Биохимический
- Иммунологический
- Паразитологический
- Экспресс- диагностики
- Микробиологический
Отделение имеет разрешение на проведение работ с микроорганизмами 3-4 группы патогенности, участвует в Федеральной системе внешней оценки качества по всем отделам.