Хирургическая служба МАУ ДГКБ № 9 представлена следующими отделениями:

В основу работы хирургической службы Детской городской клинической больницы № 9 заложен принцип бережного и щадящего отношения к детям. Применяются: лапароскопические, видео-эндоурологические,  видео-ринохирургические, видео-артроскопические операции и другие малоинвазивные технологии. Закрытый остеосинтез при переломах трубчатых костей.

Безопасность хирургического лечения  маленьких пациентов в первую очередь обеспечивается профессионализмом сотрудников. За 30 лет непрерывной хирургической деятельности и передового научного руководства кафедр Уральского государственного медицинского университета  в больнице сформировался дружный и высокопрофессиональный коллектив врачей- хирургов, операционных медицинских сестёр, младшего медицинского персонала. 80 % персонала имеют высшую квалификационную категорию.

Внедрение малоинвазивных технологий  в ежедневную, в том числе круглосуточную работу в неотложном режиме, позволило повысить качество диагностики и эффективность оперативного лечения, существенно снизить количество осложнений, получить хороший косметический эффект, сделать комфортным и безболезненным послеоперационное пребывание ребенка, ускорить его выздоровление и выписку из стационара.